La MSI MS-98E1 est une carte mère industrielle Mini-ITX conçue pour les solutions haute performance, prenant en charge les processeurs Intel® Kaby Lake et Skylake de 7e et 6e génération avec les chipsets C236/H110. Elle comprend deux emplacements SODIMM DDR4 2400 MHz pouvant accueillir jusqu'à 32 Go de mémoire. La carte mère prend en charge trois écrans indépendants via VGA, DVI-D, HDMI™ et LVDS, et dispose de deux ports LAN GbE. Les capacités d'extension comprennent des emplacements PCIe x16, Mini-PCIe (pleine taille avec support SIM), et Mini-PCIe (demi taille), ainsi que mSATA, M.2 M Key, et quatre ports SATA 3.0 pour le stockage avec prise en charge RAID. Les options de connectivité comprennent quatre ports USB 3.2 Gen 1, cinq ports USB 2.0, cinq ports COM, GPIO, PS/2, audio et un en-tête de ventilateur système, et il prend en charge Intel® AMT 11.x pour la facilité de gestion.
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