Logiciel de visualisation Bioinformatics Toolbox™

d'analysepour spectrométrie de masse

Bioinformatique Toolbox™ fournit des algorithmes et des applications pour le séquençage de prochaine génération (NGS), l'analyse de microarray, la spectrométrie de masse, et l'ontologie de gène. À l'aide des fonctions de la boîte à outils, vous pouvez lire des données génomiques et protéomiques à partir de formats de fichiers standard tels que SAM, FASTA, CEL et CDF, ainsi que de bases de données en ligne telles que l'Omnibus d'expression génétique de NCBI et GenBank®. Vous pouvez explorer et visualiser ces données à l'aide de navigateurs de séquences, de cartes thermiques spatiales et de grappes de données. La boîte à outils fournit également des techniques statistiques pour détecter les pics, imputer les valeurs pour les données manquantes et sélectionner les caractéristiques. Vous pouvez utiliser les données ChIP-Seq pour identifier les facteurs de transcription, analyser les données RNA-Seq pour identifier les gènes différentiellement exprimés, identifier les variantes du nombre de copies et les SNP dans les données de microréseaux et classifier les profils protéiques en utilisant les données de spectrométrie de masse.